自己已经解决了该问题，谢谢wecenter。
把整体原有说下：
后台微信菜单是保存在system_setting 表中
会存储为：varname为：weixin_mp_menu 的一条记录，其中text值就是存储各个菜单的设置。
而后台的“保存设置”按钮调用的是一条update 语句。
因为我自己的system_setting 表中并没有这样一条记录，因此在“保存设置”时怎么也无法保存成功，而程序也未报错。
解决办法：只需要确保system_setting 表中有varname 为weixin_mp_menu 的一条记录即可。
如果没有，自己手动新增一条，我的问题就这样解决了。
至于为何我的system_setting 表中没有这样一条记录，可能是在升级过成漏掉了？
————————————————分割线——————
我们是微信认证服务号，一切配置就绪，
自定义回复的功能是可以使用的。
但是，菜单管理中添加新的菜单后，点击保存设置没有任何错误提示，但是菜单没有添加成功。
阅读全文
收起全文
